Er war tschechischer Herkunft, wurde aber in Österreich zum Missionar ausgebildet. Seine Aufgabe sah er jedoch in der Arbeit als Ethnologe. Paul Joachim Schebesta ist durch große Teile Asiens und Afrikas gereist. Dabei verbrachte er viele Jahre bei Pygmäenvölkern und betrieb grundlegende Forschung über sie.